Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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