Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDM2AQ9Y2K7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM2AQ9Y2K7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms