Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAK1Q9UPV9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAK1Q9UPV9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms