Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USP18Q9UMW8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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