Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF346Q9UL40 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms