Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms