Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MBD1Q9UIS9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms