Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CYTH4Q9UIA0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms