Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms