Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPS7AQ9UBW8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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