Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRPC4Q9UBN4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms