Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GDE1Q9NZC3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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