Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARHGAP35Q9NRY4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms