Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHST12Q9NRB3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms