Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NRIP3Q9NQ35 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms