Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEMA4BQ9NPR2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms