Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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