Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBT6

CDH20, Cadherin-20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH20Q9HBT6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CDH20Q9HBT6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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