Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLSPNQ9HAW4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLSPNQ9HAW4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms