Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFDQ9GZP0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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