Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms