Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms