Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms