Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UPK3BQ9BT76 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UPK3BQ9BT76 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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