Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTKNQ9BST9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms