Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FYCO1Q9BQS8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms