Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3GL3Q99963 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms