Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKP4Q99569 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKP4Q99569 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms