Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMD6Q96NE9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms