Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COG3Q96JB2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms