Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTV1Q96GA3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTV1Q96GA3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms