Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MVB12AQ96EY5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms