Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms