Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRUQ92729 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.5 ms