Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A6Q92581 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms