Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TOPBP1Q92547 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TOPBP1Q92547 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms