Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG16L2Q8NAA4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG16L2Q8NAA4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms