Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZP6

RNF113B, RING finger protein 113B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113BQ8IZP6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNF113BQ8IZP6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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