Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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C9orf40Q8IXQ3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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C9orf40Q8IXQ3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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C9orf40Q8IXQ3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf40Q8IXQ3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf40Q8IXQ3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf40Q8IXQ3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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