Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPAS3Q8IXF0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms