Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM48Q8IWZ4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms