Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
STRCQ7RTU9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STRCQ7RTU9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms