Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms