Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBLN3Q6UW01 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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