Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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