Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms