Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms