Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATL3Q6DD88 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms