Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD40Q6AI12 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms