Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM236Q5W0B7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms